Série · Biochimie
Structures protéiques
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Série « Structures protéiques » sur Wikicard : 50 cartes tirées de Wikipédia, dont Structure des protéines, Extrémité N-terminale, Hélice alpha. Terminée, elle donne un badge brodé « Argent », dessiné pour elle.
Ses cartes
Structure des protéinesÉpiqueLa structure des protéines est la composition en acides aminés et la conformation en trois dimensions des protéines.
Hélice alphaÉpiqueL’hélice alpha (hélice α) est une structure secondaire courante des protéines.
Feuillet bêtaÉpiqueLes feuillets β ou feuillets β plissés est la deuxième forme de structure secondaire régulière observée dans les protéines, avec une fréquence de présence plus faible que les…
Extrémité N-terminaleÉpiqueEn structure des protéines, l'extrémité N-terminale (ou terminaison amine, terminaison aminée, terminaison N ou terminaison NH2) réfère à l’extrémité d'une protéine ou d'un…
DénaturationÉpiqueLa dénaturation est le processus par lequel une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine, perd sa conformation tridimensionnelle normale : les protéines perdent leur…
Structure secondaireÉpiqueLa structure secondaire est définie par des arrangements de liaisons hydrogène entre les groupements amide et carbonyle du squelette peptidique (les liaisons hydrogène impliquant…
Prédiction de la structure des protéinesRareLa prédiction de la structure des protéines est l'inférence de la structure tridimensionnelle des protéines à partir de leurs séquences d'acides aminés, c'est-à-dire la prédiction…-en.svg?width=320)
Structure tertiaireRareLa structure tertiaire ou tridimensionnelle est le repliement dans l'espace d'une chaîne polypeptidique.
Structure quaternaireRareLa structure quaternaire d'une protéine multimérique est la manière dont sont agencées les différentes chaînes protéiques, ou sous-unités, à l'état natif les unes par rapport aux…
Sous-unité protéiqueRareUne sous-unité protéique est une chaîne polypeptidique qui entre dans la constitution d'un complexe protéique par auto-assemblage.
Structure primaireRareLa structure primaire d'une biomolécule non-ramifiée comme une protéine ou un brin d'ADN ou d'ARN, est la séquence de nucléotides ou d'acides aminés du début à la fin de la…
Hélice de collagèneRareL'hélice de collagène est une forme essentielle de la structure secondaire du collagène.
Changement conformationnelPeu communeUn changement conformationnel est la transition entre deux géométries moléculaires, souvent induite par des facteurs environnementaux.
Amarrage moléculairePeu communeDans le domaine de la modélisation moléculaire, l’amarrage (en anglais docking) est une méthode qui calcule l'orientation préférée d'une molécule vers une seconde lorsqu'elles…- Coude (biochimie)Peu communeUn coude est un élément de la structure secondaire des protéines caractérisé par un changement de direction de la chaîne polypeptidique.
Hélice piPeu communeUne hélice π est un type de structure secondaire des protéines.- Dégradation d'EdmanPeu communeLa dégradation d'Edman, développée par Pehr Edman, est une méthode de séquençage des acides aminés dans un peptide.
Hélice polyprolinePeu communeUne hélice polyproline est un type de structure secondaire de certaines protéines présentant une répétition de résidus de proline.
Tonneau bêtaPeu communeUn tonneau β est une structure protéique constituée d'un grand feuillet β qui se tord et s'enroule pour former une structure quasi cylindrique fermée par des liaisons hydrogène.
Hélice 310Peu communeUne hélice 310 est un type de structure secondaire des protéines susceptible de se former aux extrémités des hélices α ou de manière isolée.
Hélice bêtaPeu communeUne hélice β est un élément de structure secondaire des protéines formé par l'association de brins β parallèles disposés de manière hélicoïdale à deux ou trois faces.
Protéine membranaire intégralePeu communeUne protéine membranaire intégrale, ou protéine intégrale de membrane, est une protéine en interaction permanente avec une membrane biologique.
Triade catalytiquePeu communeEn biologie moléculaire, on désigne généralement par triade catalytique les trois résidus d'acides aminés qui interviennent ensemble dans le site actif de certaines hydrolases et…
Répétitions en tandemPeu communeLes répétitions en tandem sont l'association, dans une protéine, d'au moins deux occurrences de motifs séquentiels ou de motifs structuraux semblables.- ProteopediaPeu communeProteopedia est un wiki en anglais présentant des modélisations 3D de protéines et d'autres molécules biologiques.
- Étiquette poly-histidinePeu communeUne étiquette poly-histidine est un motif d'acides aminés dans une protéine constitué d'au moins six résidus histidine, souvent insérés à l’extrémité N- ou C- terminale de la…
Agrégation des protéinesPeu communeL'agrégation des protéines (ou agrégation/agglomération protéique) est un phénomène biologique dans lequel les protéines mal repliées s'agrègent (c'est-à-dire qu'elles…- Acide aminé DPeu communeLes acides aminés D sont une classe d'acides aminés, ou pour ce qui intéresse le plus la biologie, les acides α-aminés, pour lesquels les groupes fonctionnels carboxyle (-COOH) et…
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Cristallographie électroniquePeu communeLa cristallographie électronique est une méthode permettant de déterminer la disposition des atomes dans les solides à l'aide d'un microscope électronique en transmission (MET ou…
Séquence conservéePeu communeEn biologie de l'évolution, les séquences conservées sont des séquences d'acides nucléiques (ADN et ARN) ou d'acide aminés identiques ou similaires au sein d'un génome (on parle…
Modèle rubanCommuneLe modèle ruban est une modélisation moléculaire de la structures des protéines..jpg?width=320)
Triple héliceCommuneUne triple hélice est un faisceau de trois hélices coaxiales translatées l'une par rapport à l'autre.- Motif de WalkerCommuneLes motifs de Walker sont des séquences d'acides aminés observés dans de nombreuses protéines et qui présentent une structure tridimensionnelle hautement conservée.
Protéine membranaire périphériqueCommuneUne protéine membranaire périphérique est une protéine membranaire qui n'adhère que temporairement à la membrane biologique à laquelle elle est associée.
Beta-propellerCommuneEn biologie structurelle, un β-propeller est une structure tertiaire de certaines protéines caractérisée par l'arrangement de quatre à huit feuillets β en forme de lame autour…
Trou oxyanionCommuneUn trou oxyanion est une cavité dans la structure d'une enzyme qui stabilise un atome d'oxygène ou un alcoolate déprotoné, souvent en le plaçant à proximité d'un résidu chargé…
Pont cystineCommuneUn pont cystine est un pont disulfure entre deux résidus de cystéine, un acide aminé protéinogène.
Répétition armadilloCommuneUne répétition armadillo est un type de structure rencontré dans de nombreuses protéines et constitué d'une quarantaine de résidus d'acides aminés organisés en une séquence…
Séquence RGDCommuneLa séquence RGD est un tripeptide constitué d'arginine, de glycine et d'acide aspartique (sérine), qui est le site de fixation de certaines intégrines.
Repliement jelly rollCommuneLe repliement jelly roll est un mode de repliement des protéines constitué de huit brins β arrangés en deux feuillets de quatre brins.
Domaine PASCommuneLe domaine PAS est un domaine structurel présent dans de nombreuses protéines de signalisation et qui fonctionne comme un détecteur de signal.
Repliement globineCommuneLe repliement globine est un mode de repliement courant dans les protéines de la famille des globines ainsi que de la superfamille des protéines qui leur sont homologues.
JUNQ et IPODCommuneLes JUNQ et IPOD sont évolutivement conservés et se trouvent dans des sites cellulaires spécifiques et définis.
Faisceau d'hélicesCommuneUn faisceau d'hélices (helix bundle en anglais) est une petite structure tertiaire de certaines protéines constituée de plusieurs hélices α généralement parallèles ou…- MorphéineCommuneMorphéine est parfois utilisé en référence à des protéines pouvant se replier d'au moins deux façons, chacun de ces modes de repliement s'assemblant en un homo-oligomère qui lui…
Domaine EGFCommuneDomaine EGF-like, EGF-like domain en anglais, est un domaine protéique, conservé à travers l'évolution, appelé ainsi en référence au facteur de croissance épidermique (Epidermal…
Représentation en roue hélicoïdaleCommuneUne représentation en roue hélicoïdale est un type de projection ou de représentation visuelle utilisé pour illustrer les propriétés des hélices α des protéines.
Trèfle bêtaCommuneUn trèfle β est une structure protéique comprenant trois séquences β–β–β–boucle–β repliées de telle sorte que deux épingles à cheveux β à deux brins se forment avec le premier et…
Domaine BRCTCommuneUn domaine BRTC, pour l'anglais BRCA1 C Terminus, est une structure protéique commune à une famille de protéines.- Repliement oxydatifCommuneLe repliement oxydatif est le processus responsable de la formation de ponts disulfure entre résidus de cystéine lors du repliement de certaines protéines.
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